Попов отвечал за развитие парка "Патриот" в 2021–2024 годах. В обвинительном заключении, которое зачитал представитель военной прокуратуры, отмечается, что "умысел" на создание организованной группы с целью хищения средств у Попова возник не позднее марта 2022 года. В эту группу он привлек директора парка Вячеслава Ахмедова и замначальника главного управления инновационного развития Минобороны генерал-майора Владимира Шестерова.
Судебный молоток
По данным обвинения, Попов осуществлял "общее руководство и покровительство" преступной группы, а Ахмедов и Шестеров обеспечивали "воплощение идей организатора на практике". Преступная деятельность группы заключалась в том, что за счет средств Минобороны, выделенных для парка "Патриот", были проведены строительно-монтажные работы ряда зданий на участке земли в СНТ "Звезда" под Красногорском в Московской области, который принадлежал Попову. Всего, как установило следствие, генерал вместе с соучастниками похитили у "Патриота" свыше 25 млн рублей.
Как отмечает РБК, помимо мошенничества в особо крупном размере (ч. 4 ст. 159 УК; до десяти лет лишения свободы), Попову также вменяют служебный подлог (ч. 2 ст. 292 УК; до четырех лет лишения свободы), превышение должностных полномочий (п.п. "в", "е" ч. 3 ст. 286 УК; до десяти лет заключения) и незаконный оборот оружия (ч. 1 ст. 222 УК; до пяти лет лишения свободы). Попов находится под арестом с августа 2024 года. В ноябре Ахмедов и Шестеров дали показания против бывшего замминистра обороны. Сам Попов отверг все обвинения.
В мае 2025 года адвокат Попова сообщил о госпитализации своего подзащитного из-за обострения хронической болезни, а в июне уточнил, что 68-летний генерал находится в тяжелом состоянии в НИИ скорой помощи им. Склифосовского.